Instrucciones
Usted tiene las siguientes opciones en este simulador para moléculas pequeñas tanto inorgánicas como orgánicas.
- En la parte superior, aparecen los botones 2D y 3D para que pueda observar el modelo en dos o tres dimensiones.
- A continuación se presenta el modelo en dos o tres dimensiones.
- "Search" puede ser utilizado para buscar alguna molécula, escribiendo el nombre en inglés, por ejemplo al escribir, sulphuric acid (ácido sulfúrico).
- Color de fondo, sirve seleccionar el color del fondo del modelo en tres dimensiones.
- Girar X, Y, Z, para girar el modelo en tres dimensiones en los ejes x, y, z.
- Alambres, varillas y pelotas y varillas, para cambiar el modelo en tres dimensiones en esas representaciones.
- Energía, aparce en la parte superior la energía de la molécula en kJ/mol o kcal/mol.
- Minmizar por MMFF94, normalmente las estructuras iniciales que se crean en los simuladores poseen energías mucho mayores a las que tendría un objeto real, por esta razón, se utilizan algoritmos para calcular las posiciones y fuerzas originales, con el objetivo de minimizarlas y que sean más realistas.
- Arrastrar Minimizar, usted puede arrastrar un átomo, soltarlo y entonces el sistema hace un cálculo de minimización de energía.
- Superficie VDW, La superficie de van der Waals de una molécula es una representación abstracta o modelo de esa molécula, que ilustra dónde, en términos muy generales, podría haber una superficie para la molécula en función de los cortes duros de los radios de van der Waals para átomos individuales, y representa una superficie a través de la cual la molécula podría concebirse interactuando con otras moléculas.
- PEM es el mapa de potencial electrostático.
- Cargas parciales, para ver el valor de la carga relativa positiva o negativa de cada átomo.
- Tetraedros, para el caso que exista alguna átomo tetraédrico.
- Dipolos enlaces, para ver el los dipolos de todos los enlaces.
- Dipolo molecular, para ver el momento dipolar resultante de toda la molécula.
- Botón 2D, cuando escoge el botón 2D, la aplicación tiene su propio menú y quedan inhabilitados todos los botones 3D.
Ácidos y Bases
Concepto de pH
Como manejar las concentraciones de [H+] o de [OH-] con cifras muy pequeñas y exponentes negativos resulta poco práctico, se han sustituido estos valores por el logaritmo decimal inverso de la concentración de iones H+, llamado pH, así:
Si la concentración de H+ es 10-7 moles/litro, se obtendrá que:
Como la escala de pH es logarítmica, la variación de una unidad de pH corresponde a una variación 10 veces mayor de la concentración de iones H+.
Escala de pH
Para medir el pH se pueden utilizar algunas sustancias (indicadores ácido-base) que son sensibles a la concentración de iones hidrógeno. Estas sustancias dependiendo de la acidez o basicidad del medio, cambian de color a valores de pH específicos. Algunos indicadores son de origen animal y otros pueden ser de origen vegetal. Cada uno de los colorantes tienen un color en medio ácido y otro en medio básico o alcalino. Un ejemplo puede ser el tornasol (papel pH), que presenta un color rojo en soluciones ácidas y un color azul en soluciones alcalinas (ver escala). La combinación de una serie de indicadores impregnados en un papel conocido como papel pH, presentan una gama de colores que se pueden observar conforme varía la concentración de iones hidrógeno.
Papel pH
| [H+] | pH | Ejemplo | |
| Ácidos | 1 X 100 | 0 | HCl |
| 1 x 10-1 | 1 | Jugo gástrico | |
| 1 x 10-2 | 2 | Jugo de limón | |
| 1 x 10-3 | 3 | Vinagre | |
| 1 x 10-4 | 4 | Agua gaseosa | |
| 1 x 10-5 | 5 | Agua de lluvia | |
| 1 x 10-6 | 6 | Leche | |
| Neutral | 1 x 10-7 | 7 | Agua pura |
| Bases | 1 x 10-8 | 8 | Claras de huevo |
| 1 x 10-9 | 9 | Levadura | |
| 1 x 10-10 | 10 | Leche de magnesia | |
| 1 x 10-11 | 11 | Amoníaco | |
| 1 x 10-12 | 12 | Hidróxido de calcio - Ca(OH)2 | |
| 1 x 10-13 | 13 | Limpiador de drenajes | |
| 1 x 10-14 | 14 | NaOH |
Concepto de pOH
Una escala semejante a la del pH se puede construir considerando para el cálculo la concentración del ion OH-. Esta nueva escala se define como pOH y es igual a:
Los cálculos son también similares. Así, para una solución que contiene 10-3 mol/litro de iones OH- su pOH será:
La suma del pH y del pOH es igual a 14
