Instrucciones
Usted tiene las siguientes opciones en este simulador para moléculas pequeñas tanto inorgánicas como orgánicas.
- En la parte superior, aparecen los botones 2D y 3D para que pueda observar el modelo en dos o tres dimensiones.
- A continuación se presenta el modelo en dos o tres dimensiones.
- "Search" puede ser utilizado para buscar alguna molécula, escribiendo el nombre en inglés, por ejemplo al escribir, sulphuric acid (ácido sulfúrico).
- Color de fondo, sirve seleccionar el color del fondo del modelo en tres dimensiones.
- Acercar +, acerca el modelo.
- Acercar -, aleja el modelo.
- Girar X, Y, Z, para girar el modelo en tres dimensiones en los ejes x, y, z.
- Alambres, varillas y pelotas y varillas, para cambiar el modelo en tres dimensiones en esas representaciones.
- Energía, aparce en la parte superior la energía de la molécula en kJ/mol o kcal/mol.
- Minmizar por MMFF94, normalmente las estructuras iniciales que se crean en los simuladores poseen energías mucho mayores a las que tendría un objeto real, por esta razón, se utilizan algoritmos para calcular las posiciones y fuerzas originales, con el objetivo de minimizarlas y que sean más realistas.
- Arrastrar Minimizar, usted puede arrastrar un átomo, soltarlo y entonces el sistema hace un cálculo de minimización de energía.
- Simetría, muestra los planos de simetría en la molécula.
- Editar, puede editar la molécula agragando o quitando átomos y enlaces.
- Superficie VDW, la superficie de van der Waals de una molécula es una representación abstracta o modelo de esa molécula, que ilustra dónde, en términos muy generales, podría haber una superficie para la molécula en función de los cortes duros de los radios de van der Waals para átomos individuales, y representa una superficie a través de la cual la molécula podría concebirse interactuando con otras moléculas.
- PEM es el mapa de potencial electrostático.
- Carga parcial calcula la carga parcial de cada átomo.
- Tetraedros, para el caso que exista alguna átomo tetraédrico.
- Dipolos enlaces, para ver el los dipolos de todos los enlaces.
- Dipolo molecular, para ver el momento dipolar resultante de toda la molécula.
- Hibridación sp, sp2 y sp3, para ver la hibridacion del átomo de carbono.
- Anillo aromático, muestra los anillos aromáticos.
- Heteroátomo, muestra los heteroátomos en heterociclos.
- C quiral (nomenclatura R/S) y E/Z para isomería geométrica en alquenos, los descriptores R/S permiten indicar en un compuesto orgánico la configuración (la disposición espacial de los sustituyentes) de un carbono o centro quiral, estereocentro o centro estereogénico, que es el caso de un átomo de carbono con cuatro sustituyentes diferentes. Se añade R o S entre paréntesis como prefijo delante del nombre de la molécula orgánica. En caso de ser más de uno el centro estereogénico, separados por coma se indica el descriptor R o S de cada uno, precedido del número o localizador que identifica su posición.
- Invertir R/S, para cambiar la quiralidad.
- Nomenclatura E/Z en Alquenos, el sistema tradicional para nombrar los isómeros geométricos de un alqueno, en el que los mismos grupos están dispuestos de manera diferente, es nombrarlos como cis o trans. Sin embargo, es fácil encontrar ejemplos donde el sistema cis-trans no se aplica fácilmente.
- N electrones, O electrones y S electrones, para ver los electrones libres del nitrógeno, oxígeno y azufre.
- C primario, C secundario, C terciario, C cuaternario, identifica la clasificación de los átomos de carbono.
- Dadores y aceptores de puentes de hidrógeno, señala los átomos que pueden dar o aceptar puentes de hidrógeno
- Botón 2D, cuando escoge el botón 2D, la aplicación tiene su propio menú y quedan inhabilitados todos los botones 3D.
Enlace Químico
¡Atención!
La función de onda (Ψ) se comporta como cualquier otra onda. Cuando dos olas se encuentran, pueden interactuar entre sí generando una interferencia (interacción) constructiva o destructiva.
Interferancia constructiva
En el caso de la interferencia constructiva, las dos ondas son de la misma fase, es decir, ambas son positivas (o negativas). Cuando las dos ondas se encuentran, se suman para producir una sola onda, cuyo pico es la suma de las dos ondas individuales. En el ejemplo mostrado, donde las dos ondas tienen la misma amplitud (las ondas roja y verde), la onda resultante será el doble de alta (la onda magenta).
Antes de la interferencia
Después de la interferencia
Interferancia destructiva
En el caso de interferencia destructiva, las dos ondas son de fases opuestas, una positiva (la onda roja) y la otra negativa (la onda verde). En este caso, cuando las dos ondas se encuentran, se "restan" una de otra o se cancelan entre sí. En el ejemplo mostrado, donde las dos ondas tienen la misma amplitud, se cancelarán entre sí por completo (la onda magenta).
Antes de la interferencia
Después de la interferencia
A continuación aparece un enlace de un simulador, en dónde usted puede observar dos ondas y hacer que se produzca una interferencia constructiva o destructiva, observando el resultado en la onda color azul.
Simuladores
Simulador: ... Hacer clic aquí
Sugerencia para simular la interferencia constructiva: Poner los valores de longitud de onda, amplitud y fase en 40 para ambas ondas, observará que la onda resultante (azul) es la suma de la onda 1 y la onda 2.
Sugerencia para simular la interferencia destructiva: Deje los valores de longitud de onda y amplitud igual que el caso anterior pero cambie el valor de fase de la onda 2 a 180, observará que se anulará la onda resultante (color azul).
Simulador de tanque de agua: ... Hacer clic aquí
Este efecto es importante en química, ya que la función de onda (Ψ ) describe que los electrones en un orbital se comportan como ondas produciendo tambien interferencias constructivas y destructivas.
Función de onda (Ψ)
- Interferencia constructiva (entre dos átomos "en fase") esta combinación produce un "orbital molecular de enlace" (una gran área que abarca ambos átomos en la que los dos electrones son libres de movimiento, resultado de esto ¡¡¡los átomos comparten los electrones!!!).
- Interferencia destructiva (entre dos átomos "fuera de fase") esta combinación produce un orbital molecular de "anti-enlace", donde habrá un nodo (punto donde la función de onda tiene un valor de 0) entre los dos átomos.
Considere cómo las 2 ondas de electrones pueden interactuar entre sí cuando se enlazan los 2 átomos:
En las dos imágenes de abajo:
Azul y Cian: funciones
de onda positivas para H 1s
Rojo: Función de onda negativa para H 1s
Verde lima: funciones de onda combinadas después
de interferencia constructiva o destructiva.
En la combinación en fase hay un aumento de la densidad electrónica
en la región internuclear. Esto corresponde a la forma en
la que pensamos del enlace covalente: una compartición de un par de electrones
entre dos núcleos.
Combinación con interferencia constructiva: "en fase". Observe cómo es mejorada la función de onda en la región entre los dos núcleos cuando los dos orbitales se juntan. Esto produce un orbital molecular de"enlace". orbital.
Combinación en fase
Combinación con interferencia destructiva: "fuera de fase". Observe como se reduce la función de onda en la región entre en núcleo, los orbitales "se restan" tanto como tengan fases positivas. De tal manera que se produce un nodo en el orbital entre los dos átomos. Esto produce un orbital molecular de "anti enlace"
Combinación fuera de fase
