Instrucciones
Usted tiene las siguientes opciones en este simulador para moléculas pequeñas tanto inorgánicas como orgánicas.
- En la parte superior, aparecen los botones 2D y 3D para que pueda observar el modelo en dos o tres dimensiones.
- A continuación se presenta el modelo en dos o tres dimensiones.
- "Search" puede ser utilizado para buscar alguna molécula, escribiendo el nombre en inglés, por ejemplo al escribir, sulphuric acid (ácido sulfúrico).
- Color de fondo, sirve seleccionar el color del fondo del modelo en tres dimensiones.
- Girar X, Y, Z, para girar el modelo en tres dimensiones en los ejes x, y, z.
- Alambres, varillas y pelotas y varillas, para cambiar el modelo en tres dimensiones en esas representaciones.
- Energía, aparce en la parte superior la energía de la molécula en kJ/mol o kcal/mol.
- Minmizar por MMFF94, normalmente las estructuras iniciales que se crean en los simuladores poseen energías mucho mayores a las que tendría un objeto real, por esta razón, se utilizan algoritmos para calcular las posiciones y fuerzas originales, con el objetivo de minimizarlas y que sean más realistas.
- Arrastrar Minimizar, usted puede arrastrar un átomo, soltarlo y entonces el sistema hace un cálculo de minimización de energía.
- Superficie VDW, La superficie de van der Waals de una molécula es una representación abstracta o modelo de esa molécula, que ilustra dónde, en términos muy generales, podría haber una superficie para la molécula en función de los cortes duros de los radios de van der Waals para átomos individuales, y representa una superficie a través de la cual la molécula podría concebirse interactuando con otras moléculas.
- PEM es el mapa de potencial electrostático.
- Cargas parciales, para ver el valor de la carga relativa positiva o negativa de cada átomo.
- Tetraedros, para el caso que exista alguna átomo tetraédrico.
- Dipolos enlaces, para ver el los dipolos de todos los enlaces.
- Dipolo molecular, para ver el momento dipolar resultante de toda la molécula.
- Botón 2D, cuando escoge el botón 2D, la aplicación tiene su propio menú y quedan inhabilitados todos los botones 3D.
Nomenclatura
- Todos los compuestos binarios toman la terminación –uro en el primer elemento nombrado.
- Si dos no metales se combinan para formar solamente un compuesto, éste se nombra escribiendo el nombre del segundo elemento con la terminación –uro y ligados ambos nombres con la preposición “de”.
- Compuestos de este tipo contienen hidrógeno con otro no metal.
- Para otros compuestos binarios de este tipo, donde más de un compuesto binario puede formarse a partir de dos elementos, se utilizan los prefijos griegos que aparecen en la siguiente tabla. Este sistema corresponde al “Sistema Estequiométrico”.
- El prefijo mono no se usa con el primer elemento, ejemplo en el :
- Tampoco se usa en el dióxido de carbono:
- Se acepta también el uso de números romanos para indicar los estados de oxidación de los elementos más positivos, esto corresponde al “Sistema Stock”, que es el más recomendado por la IUPAC:
- El Sistema Clásico, que todavía se utiliza bastante, toma en consideración a los óxidos de no metales que pueden reaccionar con agua para formar ácidos. Estos óxidos de no metal (óxidos ácidos) se nombran como anhídridos. Ejemplos:
