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Diferentes formas de representación de las moléculas
- "Amino" es un esquema que asigna colores a los aminoácidos en función de sus propiedades químicas, p. ácido, básico, hidrofóbico o polar. Los colores son ASP, GLU, CYS, MET, LYS, ARG, SER, THR, PHE, TYR, ASN, GLN, GLY, LEU, VAL, ILE, ALA, TRP, HIS y PRO. Los ácidos nucleicos son de color caré claro en el esquema "amino".
- "Cadena" es un esquema que da un color diferente a cada cadena del archivo pdb.
- "Grupo" es un esquema que colorea las cadenas de proteínas de manera diferencial en la dirección amino-carboxi. Este esquema también colorea las cadenas de ácido nucleico de manera diferencial en la dirección 5 '> 3'.
- "Temperatura" es un esquema que colorea los átomos de acuerdo con sus temperaturas anisotrópicas, almacenadas como un valor beta en un archivo pdb. La temperatura anisotrópica indica la movilidad de un átomo o la incertidumbre de posición. Los segmentos más "móviles" y más cálidos son de color rojo, progresando a fragmentos azules más inmóviles.
- "Estructura" es un esquema de color muy útil porque colorea de manera diferencial la estructura secundaria de una proteína (hélices α y láminas β). Es mejor usar un comando de visualización que ilustre la estructura secundaria cuando se utiliza el esquema de colores de la estructura (por ejemplo, cintas, dibujos animados, esqueleto, trazas o hebras; consulte la sección Visualización).
Clasificación de los aminoácidos
- Ácidos: Asp, Glu
- No cíclicos
- Alifáticos: Ala, Gly, Ile, Leu, Val
- Aromáticos: His, Phe, Trp, Tyr
- Básicos: Arg, His, Lys
- Interiores: Ala, Leu, Val, Ile, Phe, Cys, Met, Trp
- Con carga: Asp, Glu, Arg, His, Lys
- Hidrofóbicos: Ala, Leu, Val, Ile, Pro, Phe, Met, Trp
- Polares: Cys, Gly, Ser, Thr, Lys, Asp, Asn, Glu, Arg, Gln, Tyr, His
- Pequeños: Ala, Gly, Ser
Metales
Grupos Prostéticos
Superficie y Cavidades
Sección
Portada Alcoholes
Cirrosis Alcohólica
En su chequeo de rutina, Sandra menciona que ha estado sintiendo más cansada de lo habitual, probablemente debido a un par de meses estresantes en el trabajo. Después de algunas dudas, Sandra agrega que ha estado bebiendo bastante vino durante y después de la cena para ayudarla a relajarse después de su jornada laboral, hasta el punto en que con frecuencia se siente con resaca a la mañana siguiente. Su médico decide ordenar una serie de análisis de sangre para evaluar la función hepática de Sandra. Estas pruebas verifican los niveles de varias enzimas que se producen en células hepáticas, donde ayudan en el procesamiento de aminoácidos y otros nutrientes. Algunas situaciones que dañan el hígado matan un gran número de células hepáticas, y las enzimas que estaban en las células terminan en el torrente sanguíneo.
La sangre de Sandra muestra niveles más altos de lo normal de dos enzimas, la y , siendo particularmente visible el aumento de este último nivel. El nivel de otra enzima, la fosfatasa alcalina, está dentro del rango normal. Con base en estos y otros resultados, el médico de Sandra le dice que tiene hepatitis alcohólica leve, una inflamación del hígado que es el resultado de su aumento del consumo de alcohol.
